دکتر حسین خنیفر در جلسه شورایعالی قرآن وزارت آموزش و پرورش که با حضور وزیر و مدیران دستگاههای قرآن برگزار شد.
با اهمیت شمردن فعالیت های قرآنی در تربیت معلم ارزشی، برنامه های قرآنی دانشگاه فرهنگیان را در قالب طرح هایی مانند، حفظ جزء سی ام قرآن، "طرح سراج" برنامه هایی دوشنبه های قرآنی که تمام دانشجویان ساعتی از برنامه های آموزشی خود را به تدبر در مفاهیم قرآنی می پردازند اشاره کرد. ایشان از طرح کاروان های نور به مناسبت ماه مبارک رمضان یاد کردند که در این طرح دانشگاه فرهنگیان در استان های سراسر کشور میزبان تمام دانشجویان استان خواهند بود، که در این میزبانی ضمن تلاوت قرآن با حضورقاریان بین المللی به ارائه مباحث قرآنی و تفسیر قرآن در خوابگاه ها می پردازد. دکتر خنیفر در پایان دانشگاه فرهنگیان را میزبان نمایشگاه بین المللی قرآن در مصلی تهران در بخش دانشجویی اعلام کردند و بیان داشتند؛ که این میزبانی افتخاری است برای خادمی قرآن کریم که بیش از سه میلیون بازدید کننده دارد و تمهید لازم برای استفاده از فرصت پیش رو فراهم شده است.