دکتر مصطفایی پور اولین دانشمند برتر در بین کل رشته های مهندسی استان یزد است که در این جایگاه قرار گرفته است.
این استادیار دانشگاه، در کارنامه پژوهشی خود عنوان پژوهشگر نمونه دانشگاه را دارد. ضمنا وی تاکنون ۴ کتاب فارسی و یک فصل کتاب انگلیسی  به چاپ رسانده‌است، ۳ ثبت اختراع و چندین جایزه در کنفرانس های بین المللی معتبر خارج از کشور نیز از دیگر افتخارات و دستاوردهای دکتر مصطفایی پور است. وی عضو هیات تحریریه ۱۰ ژورنال خارجی، سردبیر میهمان ۲ نشریه خارجی و همچنین سردبیر یک نشریه آمریکایی در رابطه با انرژی است.

دکتر مصطفایی پور همچنین ۸۶ مقاله کنفرانس‌های بین المللی ارایه و به چاپ رسانده و دارای ۷۶ مقاله در ژورنالهای آی اس آی با ضریب بالای Q۱ است. وی تاکنون عضو کمیته علمی ۱۷۷ کنفرانس بین المللی بوده که اکثر آنها در آمریکا برگزار شده است و کارهای تحقیقاتی به اتمام رسیده اش ۱۸ مورد است.
شایان ذکر است در دانشگاه یزد پیش از این دکتر بیژن دواز، دکتر محمد مظلوم و دکتر حمیدرضا زارع سه عضو هیات علمی از پردیس علوم به این افتخار دست یافته بودند.
پایگاه استنادی طلایه‌داران علم تامسون رویترز (ISI-ESI) بر اساس فعالیت ۱۰ سال اخیر پژوهشگران دانشگاه‌های مختلف به ارایه فهرستی از دانشمندان برتر دنیا می‌پردازد که براساس آخرین تحولات در شبکه علم بین‌الملل به‌روزرسانی می‌شود.
معیار انتخاب پژوهشگران برتر، تعداد استنادهای صورت‌گرفته به تولیدات علمی آن‌ها در رشته‌ و حوزه‌های موضوعی بیست و دوگانه مورد ارزیابی این پایگاه است. بر همین اساس پژوهشگرانی که بر اساس مقالات چاپ‌شده خود، بالاترین استناد را داشته‌اند، مرتب‌سازی و سپس یک درصد برتر آن‌ها، در حوزه‌های مختلف انتخاب و معرفی می‌شوند.