در جلسه ای که با حضور اساتید و صاحبنظران حوزه میکروب شناسی و اعضای هیات مدیره انجمن علمی میکروب شناسی ایران در تاریخ ۱۲ دیماه ۱۳۹۸ در محل دفتر انجمن برگزار گردید، پس از بحث و تبادل نظر، محورهای اصلی بیست و یکمین کنگره میکروبشتاسی ایران، مشخص گردید. این کنگره در تاریخ ۳۰-۲۸ مردادماه ۱۳۹۹ در دانشگاه علوم پزشکی تهران برگزار خواهد شد . محورهای این کنگره شامل موارد ذیل خواهد بود:

۱- میکروب­شناسی بالینی (عفونت­های ویژه هر ارگان)

۲- روش­های کنترل و کاهش مقاومت­های دارویی (با محوریت نقش میکروبشناسان در کمیته­های کنترل عفونت و کمیته کنترل و تجویز منطقی آنتی بیوتیک)

۳- روش­های نوین در تشخیص میکروارگانیسم­ها - سیستماتیک مدرن میکروارگانیسم (با محوریت میکروب­های غیر قابل کشت)

۴- میکروبشناسی بالینی و تشخیص آزمایشگاهی (با محوریت جایگاه ویژه میکروب­شناسان در بالین)

۵- درمان­های نوین جایگزین در عفونت­های میکروبی (با محوریت فاژتراپی، گیاهان دارویی و ترکیبات طبیعی ضدمیکروبی)

۶- کنترل کیفی در آزمایشگاه میکروب­شناسی

۷- پیشگیری، کنترل و واکسن؛ چالش­ها و معضلات در ایران

۸- بیماری­های بازپدید و نوپدید

۹- میکروب و سرطان

۱۰- علوم نوین و میکروبیولوژی (با محوریت سیستم بیولوژی، بیوانفورماتیک، بیوتکنولوژی و نانو فناوری پزشکی)

۱۱- مشکلات و چالش­ها در آموزش میکروب شناسی در دانشگاه­های ایران

۱۲- نقش آزمایشگاه های میکروبیولوژی در حوادث و بلایای طبیعی

۱۳- میکروبشناسی آب و پساب

۱۴- کار آفرینی و ارتباط با صنعت در حوزه میکروب شناسی (با محوریت ارائه دستاوردهای شرکت­های دانش بنیان)

۱۵- بیماری­های مشترک بین انسان دام

۱۶- میکروبیولوژی مواد غذایی (با محوریت پروبیوتیک، پروبیوتیک و میکروبیوتای دستگاه گوارش)